植物乳植杆菌核酸检测试剂盒(荧光PCR探针法)
【产品名称】 植物乳植杆菌核酸检测试剂盒(荧光PCR探针法)
【包装规格】 50T/盒
【货号】 YB-72597NPR
【产品简介】
植物乳植杆菌(Lactiplantibacillus plantarum,旧名 Lactobacillus plantarum)是一种 广泛分布于自然界的革兰氏阳性乳酸菌,属于乳杆菌科(Lactobacillaceae)。其生境极 为广泛,主要存在于多种发酵性植物性食品(如泡菜、酸菜、发酵豆制品等)、乳制品、 动物肠道以及某些发酵肉制品中。
植物乳植杆菌具备良好的环境适应性,能在较广的 pH 和温度范围内生长,并能耐受一 定的盐分和胃肠道环境,是一种重要的益生菌。该菌株能够调节肠道微生态平衡,促进有 益菌增殖,抑制有害菌的生长,有助于维护肠道健康;还能增强宿主免疫力,参与抗氧化 反应,降低胆固醇水平,改善乳糖不耐受症状,预防和缓解腹泻以及控制部分过敏反应。 部分株系甚至可产生具备抗菌活性的物质(如植菌素),用于食品防腐和安全保障。此外, 植物乳植杆菌具有较强的发酵能力,能够高效发酵多种碳水化合物,并产生较多的乳酸, 从而显著改善食品的风味和品质。由于其安全性高、毒性低、耐受性强等优点,被国际食 品安全组织(如 EFSA、FDA)认可为“安全菌株”,广泛应用于功能性食品及动物饲料添 加剂等多个领域。
【试剂组成】
| 成分 | 编号 | 规格 |
| 酶混合液 | 试剂一 | 500 µL×1 管 |
| PCR反应液 | 试剂二 | 400µL×1 管 |
| 模板稀释液 | 试剂三 | 1 mL×1 管 |
高浓度标准品 (107copies/μL) | 试剂四 | 50 µL×1 管 |
| 说明书 | 1份 |
注意:高浓度标准品用于制备绝对定量的标准曲线,但易污染检测样本,需要在远离样本的区域用带滤芯的枪头先稀释成103 copies/μL,方可作为阳性对照使用。
【储存条件及有效期】
-20℃, 避光保存、运输、反复冻融少于7次,有效期12个月。
【适用仪器】
ABI 、安捷伦 MX3000P/3005P、LightCycler、Bio-Rad、eppendorf 等系列荧光定量 PCR检测仪。
【样本采集及存放】
1 样本采集
1.1 工具
棉拭子、一次性无菌注射器、剪刀、镊子、研钵、1.5 mL离心管、移液器吸头、药匙。所有上述取样工具应经121℃,15min高压灭菌并烘干;1.5 mL 离心管、吸头应无DNA酶污染。
1.2 采样方法
拭子样品:鼻拭子采样,采样时要将灭菌处理过的拭子深入鼻腔来回刮3次~5次,取鼻腔分泌液。
肛门拭子:将灭菌处理过的拭子深入肛门转一圈蘸取粪便。粪便采样用高压过的药匙取新鲜的粪便,往往为稀便或血便。组织样品:组织样品采集时应采取有明显病变组织,编号备用。
2 存放与运送
采集或处理的样品在2℃~8℃条件下保存应不超过24 h;若需长期保存,放置-70℃冰箱,但应避免反复冻融。采集的样品密封后,采用样品箱加冰密封,尽快运送到实验室。
【使用方法】
1. 样品处理(样本处理区)
1.1 RNA提取
1 核酸提取请参照相关商品RNA提取试剂盒说明书进行操作即可。
2. 稀释标准曲线样品(以1E2-1E7拷贝/μL这6个10倍稀释度为例)
由于标准品浓度非常高, 因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分。
2.1 标记5个离心管,分别为6,5,4,3,2。
2.2 用带芯枪头分别加入45 μL荧光PCR专用模板稀释液,用带芯枪头,下同。
2.3 在6号管中加入5 μL1E7拷贝/μL的阳性对照(试剂盒提供),吹打混匀,得1E6拷贝/μL的标准曲线样品,放冰上待用。
2.4 换枪头,在5号管中加入5 μL1E6拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),吹打混匀,得1E5拷贝/μL的标准曲线样品,放冰上待用。
2.5 换枪头,在4号管中加入5 μL1E5拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),吹打混匀,得1E4拷贝/μL的标准曲线样品,放冰上待用。
2.6 重复上面的操作直到得到6个稀释度的标准曲线样品,放冰上待用。
若无需制作标准曲线,将阳性对照稀释到1E5拷贝/μL即可。
3. Probe RT-PCR反应(20μL体系,在样品制备室进行,冰上操作)
3.1 从-20℃以下冰箱中取出试剂盒,在室温融化后置于冰上。待完全溶解后上下颠倒轻轻混匀(请不要使用振荡器进行混匀),尽量避免出现泡沫并低速离心10s。
3.2 根据待检测样本总数,设所需要的PCR反应管管数为N(N=样本数+1管阴性对照+1管阳性对照;样品每满7份,多配制1份),每测试反应体系配制如下表:
| 试剂 | 酶混合液 | PCR反应液 |
| 用量(样本数为N) | 10 μL | 8 μL |
根据测试样品的数量计算好各试剂的使用量,加入到适当体积试管中,充分混合均匀,向每个PCR管中各分装18 μL反应混合液,盖上管盖后将PCR反应管转移至样本处理区。
3.3 加样(在样本处理区进行)
将制备的核酸样本、阳性对照(105 copies/μL)各取2 μL分别加入PCR管中,盖好管盖,低速离心30秒后立即进行PCR扩增反应。
注意:每孔反应液中RNA模板量小于200 ng。
将 PCR 反应管转移至样本准备区,剩余试剂放回-20℃以下冰箱冷冻保存。
4. 上机检测(在检测区进行)
将PCR反应管放入荧光PCR检测仪内,按照下表设置核酸扩增相关参数,选择ROX荧光通道。
推荐循环参数设置:
| 阶段 | 循环数 | 温度 | 时间 | ROX荧光信号采集 |
| 反转录 | 1× | 42℃ | 30 min | 否 |
| 预变性 | 1× | 95℃ | 5 min | 否 |
| 变性 | 40× | 95℃ | 15 s | 否 |
| 退火/延伸 | 55℃ | 40 s | 是 |
5. 结果分析判定
5.1 结果判断
当同时满足以下条件时可判定试验成立,否则试验无效:
阳性对照:FAM通道Ct值≤35;
阴性对照:FAM通道无Ct值或Ct值>35。
5.2 检测结果
(1) 进行定量检测时,需以阳性对照浓度的log值为横轴,以Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的Ct值从标准曲线上推算出样品RNA拷贝数浓度的log值,再推算出其拷贝数浓度。
(2) 进行定性检测时:Ct值<38,有明显指数增长,表明样本中检测出牛病毒性腹泻病毒,结果为阳性;Ct值>40或无Ct值,表明样本中未检测出牛病毒性腹泻病毒,结果为阴性;Ct值在38-40范围,应对样本进行复检,如重复实验结果Ct值仍在38-40范围,有明显指数增长,则判定为阳性,否则为阴性。
【注意事项】
所有操作严格按照说明书进行;
试剂盒内各种组分使用前应自然融化,完全混匀并短暂离心;
加样时应使样品落入反应液中,不应有样品黏附于管壁上,加样后应尽快压紧管盖;
反应液应避光保存;
反应中尽量避免气泡存在,管盖需盖紧;
使用一次性吸头、一次性手套和各区专用工作服;
样本处理、试剂配制、加样需在不同区进行, 以免交叉污染;
实验完毕后用10%次氯酸或75%酒精或紫外灯处理工作台和移液器;
试剂盒里所有物品应视为污染物对待,并按照《微生物生物医学实验室生物安全通则》进行处理。
【检测方法的局限性】
样本检测结果与样本收集、处理、运送以及保存质量有关;
样本提取过程中没有控制好交叉污染,会出现假阳性结果;
阳性对照、扩增产物泄漏,会导致假阳性结果;
病原体在流行过程中基因突变、重组,会导致假阴性结果;
不同的提取方法存在提取效率差异,会导致假阴性结果;
试剂运输,保存不当或试剂配制不准确引起的试剂检测效能下降,出现假阴性或定量检测不准确的结果;
本检测结果仅供参考,如须确诊请结合临床症状以及其他检测手段。
本产品仅供科研使用。不能用于人和动物治疗等其它临床诊断使用!
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